More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2529 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
345 aa  692    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  73.62 
 
 
345 aa  504  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
317 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
317 aa  276  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
325 aa  271  9e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
404 aa  267  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
316 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
317 aa  256  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
309 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
309 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
311 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
313 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
315 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
331 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
328 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
317 aa  245  8e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
326 aa  245  9e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  34.57 
 
 
824 aa  231  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  36.07 
 
 
397 aa  223  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
348 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
361 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
352 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
374 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
338 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
372 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
372 aa  170  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  33.24 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 
388 aa  153  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
314 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
315 aa  142  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
336 aa  137  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
319 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  26.05 
 
 
791 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 
404 aa  89.4  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0006  tyrosyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274156  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 
405 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
399 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
392 aa  86.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
399 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
399 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
395 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
399 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 
401 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  30.25 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  30 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  30 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3699  tyrosyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 
393 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3069  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
413 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>