More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2108 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
314 aa  640    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  85.58 
 
 
315 aa  566  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  85.71 
 
 
319 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  77.56 
 
 
336 aa  521  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
352 aa  285  5.999999999999999e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
361 aa  285  7e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
338 aa  265  8e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
319 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
309 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
311 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
316 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
315 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
309 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
317 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
317 aa  186  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
313 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
388 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
372 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
317 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
328 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
326 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.37 
 
 
349 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
313 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
372 aa  168  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
348 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
372 aa  163  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
331 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
374 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
345 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 
345 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  28.81 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  31.91 
 
 
791 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  26.37 
 
 
824 aa  99.4  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 
401 aa  69.3  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0845  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  24.52 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0300  tyrosyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
403 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139945  normal  0.0172609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3541  tyrosyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
398 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
406 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 
398 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 
432 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1009  tyrosyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 
403 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4044  tyrosyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 
433 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225408  normal  0.0290637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
398 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  23 
 
 
403 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0944  tyrosyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 
447 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.567756  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  23 
 
 
403 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
395 aa  63.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 
403 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  22.42 
 
 
398 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 
402 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 
413 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
398 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 
416 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 
399 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
404 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 
413 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
407 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 
413 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>