198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1751 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
348 aa  719    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
372 aa  268  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
372 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
361 aa  260  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
338 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
372 aa  256  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
388 aa  246  6e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
352 aa  243  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  36.22 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
317 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
345 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
317 aa  202  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
313 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
309 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
309 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
319 aa  192  9e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
313 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
317 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
331 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
326 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
317 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
315 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
328 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
315 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
314 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
319 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  27.91 
 
 
824 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  26.94 
 
 
791 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  24.93 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 
399 aa  62.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  24.45 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  21.93 
 
 
403 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
405 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
399 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 
405 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  24 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
406 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0125  tyrosyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 
418 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000022394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 
399 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
401 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 
403 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 
398 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 
403 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 
399 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1094  tyrosyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
416 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.63976  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 
405 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 
408 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  23.6 
 
 
402 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 
403 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  21.61 
 
 
398 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 
395 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 
398 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 
413 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  22.63 
 
 
399 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  21.18 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
405 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 
413 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0142  tyrosyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 
418 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000366869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.19 
 
 
345 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.04 
 
 
341 aa  49.3  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 
407 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  20.42 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  21.94 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  20.88 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  21.08 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  20.41 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>