More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2498 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
315 aa  647    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  77.24 
 
 
313 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  71.66 
 
 
317 aa  487  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  73.4 
 
 
313 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  71.34 
 
 
316 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
317 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
325 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 
317 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
309 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
311 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
309 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
328 aa  311  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
317 aa  311  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
331 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
326 aa  308  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
338 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
345 aa  248  9e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
361 aa  225  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
352 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
315 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  36.34 
 
 
824 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
404 aa  196  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
372 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
314 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
336 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
348 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
374 aa  185  7e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
372 aa  185  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
372 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  33.95 
 
 
349 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  35.71 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
388 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  25.72 
 
 
791 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
400 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
398 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
401 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
399 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
405 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
402 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
413 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 
406 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 
414 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
432 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 
403 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
399 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
403 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
397 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 
403 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
403 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 
393 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 
392 aa  86.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 
407 aa  85.9  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 
402 aa  85.9  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
407 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  30.08 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
403 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
404 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 
413 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 
435 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
401 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>