More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0637 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
392 aa  796    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
400 aa  496  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
403 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
403 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 
403 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  55 
 
 
408 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 
404 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 
398 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
398 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
403 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
398 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
399 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
400 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
399 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
396 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 
403 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
413 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  52 
 
 
406 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 
399 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
399 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
400 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
399 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
397 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
401 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
398 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
399 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
407 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
402 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 
401 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
401 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 
399 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
401 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
399 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0841  tyrosyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
387 aa  418  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0450822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
399 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 
395 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
399 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
401 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
399 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
399 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
404 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
403 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
407 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
403 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
432 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 
403 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
399 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 
398 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0618  tyrosyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
400 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
407 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
413 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
395 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
400 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  51 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
398 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
413 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
413 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 
398 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
413 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
413 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
398 aa  401  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
413 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
395 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
398 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
413 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1094  tyrosyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.63976  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
405 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  48 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
405 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
398 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
397 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
397 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
399 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
410 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
410 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
413 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
413 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
399 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>