More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0690 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
311 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  97.08 
 
 
309 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  96.43 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  85.06 
 
 
319 aa  551  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  75.65 
 
 
317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
325 aa  346  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
316 aa  339  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 
317 aa  338  8e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
315 aa  335  7e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
313 aa  332  6e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
317 aa  331  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
317 aa  316  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
331 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
338 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
345 aa  255  8e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
345 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
315 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
319 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
314 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
336 aa  192  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  34.65 
 
 
824 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
404 aa  182  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
374 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
372 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
372 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.17 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
372 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  31.76 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  28.91 
 
 
791 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
407 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
392 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 
406 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
410 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 
405 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 
403 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 
405 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
405 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
403 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
413 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
402 aa  86.3  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
405 aa  85.9  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  30 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  27.85 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
406 aa  82.4  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 
400 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
399 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0142  tyrosyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000366869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0125  tyrosyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000022394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>