More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1311 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 388 aa  779    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3541  tyrosyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 397 aa  375  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0841  tyrosyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0450822 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 392 aa  368  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0006  tyrosyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 413 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1009  tyrosyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 404 aa  362  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 454 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 398 aa  362  9e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0506  tyrosyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 413 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 413 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 413 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  47.49 
 
 		 438 aa  359  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 413 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 413 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 413 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 416 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 413 aa  358  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1094  tyrosyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.63976  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 416 aa  355  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 399 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 405 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 398 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>