66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1659 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 388 aa  786    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 348 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.6 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 319 aa  166  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 317 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 		 317 aa  154  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 345 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  30.09 
 
 		 791 aa  135  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  26.58 
 
 		 824 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  26.99 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  22.86 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  21.68 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  21.68 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06488  tryptophanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05340)  24.07 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000000462184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  23.66 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  21.05 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1211  tyrosyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>