More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2455 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
313 aa  648    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  75.08 
 
 
313 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  73.4 
 
 
315 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  72.12 
 
 
316 aa  481  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 
317 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 
317 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
325 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  60 
 
 
317 aa  358  6e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
317 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
345 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
338 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
345 aa  226  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
361 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
352 aa  201  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
348 aa  199  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
372 aa  179  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  37.3 
 
 
349 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  34.2 
 
 
824 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
372 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
314 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
319 aa  169  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
374 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
388 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  33.94 
 
 
397 aa  152  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  26.97 
 
 
791 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
403 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
403 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
404 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 
402 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 
414 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
403 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
400 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
395 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
403 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
405 aa  89.7  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3069  tyrosyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
413 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498889  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
413 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
432 aa  86.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
408 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 
398 aa  85.9  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 
400 aa  85.9  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 
403 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
398 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 
403 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
402 aa  82  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  28 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>