More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2791 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
316 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 
313 aa  498  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  71.34 
 
 
315 aa  486  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  72.12 
 
 
313 aa  481  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 
317 aa  432  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
317 aa  394  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  61.51 
 
 
317 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 
325 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
311 aa  339  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
309 aa  339  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 
309 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
319 aa  325  5e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
331 aa  298  7e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
326 aa  297  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
345 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
338 aa  239  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
345 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
352 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
315 aa  194  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
314 aa  192  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
319 aa  190  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
336 aa  186  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
372 aa  182  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
372 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  34.29 
 
 
824 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
372 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.62 
 
 
349 aa  169  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  34.35 
 
 
397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
374 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
388 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  28.21 
 
 
791 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 
401 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
400 aa  89.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 
398 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 
399 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
403 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 
414 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 
403 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 
403 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
399 aa  86.7  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
403 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
398 aa  86.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
402 aa  86.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
392 aa  85.9  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0142  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000366869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 
400 aa  84  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
399 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
399 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
398 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
403 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
399 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
399 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0125  tyrosyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000022394  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  29 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
398 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  29 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  29 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  29 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0300  tyrosyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139945  normal  0.0172609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  29 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>