More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1048 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
325 aa  670    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  61.46 
 
 
317 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 
317 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
315 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
317 aa  384  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
313 aa  382  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 
316 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
313 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
311 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
309 aa  345  8e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
326 aa  331  8e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
319 aa  331  8e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
331 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
328 aa  325  5e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
345 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
338 aa  246  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
345 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
348 aa  221  9e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
336 aa  209  4e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
374 aa  209  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
315 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  34.29 
 
 
824 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
319 aa  199  5e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
372 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
372 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
372 aa  192  9e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.26 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
372 aa  183  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
388 aa  172  9e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  32.82 
 
 
397 aa  169  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  27.43 
 
 
791 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
403 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
403 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
399 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
400 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
403 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
400 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 
432 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
407 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
405 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 
406 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
401 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
401 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
401 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
413 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 
399 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
402 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
410 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
400 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 
395 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
413 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
399 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
410 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 
403 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
401 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
401 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 
410 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
404 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02940  tyrosyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
413 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
401 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
399 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
397 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 
403 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
406 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
399 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
399 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
407 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
408 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
399 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
393 aa  96.7  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  29.01 
 
 
438 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
398 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
396 aa  96.3  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
399 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
392 aa  95.9  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
403 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
398 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
421 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
421 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
399 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
399 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 
392 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
397 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
399 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3150  tyrosyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
424 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0347035  hitchhiker  0.00193972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
405 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
398 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
410 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>