276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74631 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 404 aa  817    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  52.45 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  46.31 
 
 		 824 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 317 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 315 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 317 aa  195  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 319 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 309 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 361 aa  143  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  29.7 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 314 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 319 aa  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 338 aa  103  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 336 aa  103  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  22.58 
 
 		 791 aa  70.1  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  23.56 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  26.29 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1714  tyrosyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0845  tyrosyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>