More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1292 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  78.27 
 
 
407 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  78.27 
 
 
407 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
406 aa  826    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  72.25 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2570  tyrosyl-tRNA synthetase  72.57 
 
 
402 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 
398 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0857  tyrosyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 
403 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.16761  hitchhiker  0.00258196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2067  tyrosyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
418 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2102  tyrosyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
415 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
415 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0567  tyrosyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 
415 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13831  tyrosyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 
415 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05611  tyrosyl-tRNA synthetase  61.23 
 
 
408 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14901  tyrosyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
412 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15151  tyrosyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15291  tyrosyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
412 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1427  tyrosyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
412 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
413 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
407 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
413 aa  345  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
406 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
413 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
396 aa  338  8e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  45.35 
 
 
438 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
404 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
412 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
400 aa  329  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
407 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
398 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
410 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
399 aa  324  2e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
388 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
399 aa  324  2e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
400 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
402 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
398 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
399 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
400 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
421 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
413 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
410 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
398 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
405 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
403 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
435 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
432 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
398 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
395 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
413 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
399 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
403 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
403 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
395 aa  316  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
410 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1714  tyrosyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
422 aa  315  7e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
398 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
398 aa  315  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
416 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
408 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
454 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3150  tyrosyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0347035  hitchhiker  0.00193972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0632  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
399 aa  313  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
413 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
413 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
413 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
413 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
395 aa  312  5.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0611  tyrosyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
410 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  42 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
403 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
413 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
398 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
432 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
413 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
413 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
403 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
404 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0506  tyrosyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
410 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
413 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
399 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
403 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>