More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0900 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  97.59 
 
 
415 aa  823    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
415 aa  839    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13831  tyrosyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05611  tyrosyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 
408 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2102  tyrosyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 
415 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0567  tyrosyl-tRNA synthetase  63.97 
 
 
415 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15291  tyrosyl-tRNA synthetase  61.94 
 
 
412 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15151  tyrosyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 
412 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14901  tyrosyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
412 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 
407 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 
407 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1427  tyrosyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 
412 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2570  tyrosyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 
402 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
405 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
406 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0857  tyrosyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
403 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.16761  hitchhiker  0.00258196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 
398 aa  425  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2067  tyrosyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
418 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
413 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
407 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
413 aa  332  9e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
406 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
392 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
421 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
421 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
407 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
401 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
410 aa  315  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
413 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
410 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3150  tyrosyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
424 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0347035  hitchhiker  0.00193972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
410 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
404 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
413 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
410 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
416 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  40.19 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
435 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
400 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
402 aa  305  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
413 aa  305  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0506  tyrosyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3541  tyrosyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4106  tyrosyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
404 aa  303  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
401 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
403 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
403 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0728  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
414 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
388 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
399 aa  299  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
401 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
397 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
397 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0944  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
447 aa  298  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.567756  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
397 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
403 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
397 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
398 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
398 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
395 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
404 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
397 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
398 aa  296  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>