More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0886 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
396 aa  804    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 
413 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 
407 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  59.16 
 
 
406 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 
432 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
404 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
413 aa  454  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  57.04 
 
 
438 aa  454  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  57 
 
 
407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
403 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 
403 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
401 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
403 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
403 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
401 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 
405 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
402 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 
408 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 
398 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
398 aa  428  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
404 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
401 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
395 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
398 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
398 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
403 aa  424  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
408 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
403 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 
398 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
413 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
398 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
400 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
398 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
398 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
395 aa  413  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
398 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
410 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
398 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
398 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
396 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
399 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
397 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
400 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0618  tyrosyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
400 aa  404  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
395 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
399 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
399 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
395 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
404 aa  398  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
401 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
397 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  48 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
398 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
399 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
403 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
399 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
413 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
413 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
413 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
454 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
397 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
421 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
399 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
399 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
398 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
403 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
413 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
410 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
399 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
405 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
392 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
402 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
399 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
416 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
399 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>