More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05700 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
407 aa  825    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 
406 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
407 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
413 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
432 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
404 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
405 aa  478  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  57.43 
 
 
438 aa  478  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
404 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
403 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
403 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 
408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
401 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
413 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 
403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
398 aa  450  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  57 
 
 
396 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
397 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
400 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
396 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 
401 aa  435  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
399 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
399 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
399 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
398 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
398 aa  431  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
399 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
400 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
413 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
404 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
398 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
398 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
399 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
398 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
400 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
401 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
398 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
414 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
399 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
408 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
399 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
396 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 
407 aa  421  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
454 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
398 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
413 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
399 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
396 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
416 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 
405 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
401 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
398 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
398 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
399 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 
406 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
403 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
399 aa  418  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
401 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
401 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 
398 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  53 
 
 
432 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
416 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
405 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
403 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0648  tyrosyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
402 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
407 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
398 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
413 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
396 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
392 aa  418  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>