More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1777 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
315 aa  638    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  93.94 
 
 
319 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  85.58 
 
 
314 aa  566  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  80.63 
 
 
336 aa  532  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
361 aa  288  7e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
325 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
319 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
315 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
317 aa  203  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
309 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
311 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
317 aa  199  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
316 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
317 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  36 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
372 aa  190  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
372 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
326 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
372 aa  175  9e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
331 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
348 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  34.63 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
345 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 
345 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  28.18 
 
 
791 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  30.13 
 
 
397 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  28.26 
 
 
824 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0845  tyrosyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
426 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2556  Tryptophan--tRNA ligase  27.62 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  22.98 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0944  tyrosyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
447 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.567756  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 
401 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 
404 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  24.9 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
435 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 
403 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
413 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
416 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3541  tyrosyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
405 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 
395 aa  63.5  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  22.27 
 
 
405 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 
398 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 
403 aa  62.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
413 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
407 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 
402 aa  62.8  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 
432 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 
398 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>