More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1723 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 398 aa  813    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  71.97 
 
 		 398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 		 401 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 401 aa  558  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1094  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.63976  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  51.65 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 408 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 399 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 403 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 395 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 398 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>