More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0568 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
405 aa  837    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  75.81 
 
 
405 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  77.25 
 
 
405 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  75.75 
 
 
405 aa  631  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  74.19 
 
 
402 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  71.18 
 
 
406 aa  599  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  72.5 
 
 
405 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 
413 aa  461  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
404 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
401 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
398 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
398 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
407 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
406 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
413 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
405 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
408 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
413 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
397 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  51.78 
 
 
438 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
432 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
412 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
396 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
395 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
403 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
403 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
403 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
392 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
407 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
398 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
403 aa  362  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
398 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
400 aa  361  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
400 aa  359  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
399 aa  356  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
404 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
395 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
401 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
399 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
403 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
399 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
395 aa  348  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  46 
 
 
405 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  46 
 
 
407 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
396 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
395 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
400 aa  345  7e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
399 aa  345  8.999999999999999e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  45 
 
 
421 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
421 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
399 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
397 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
395 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
413 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
396 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
410 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
399 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1009  tyrosyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
403 aa  340  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
392 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
410 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1094  tyrosyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
416 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.63976  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
401 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
403 aa  338  9e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
403 aa  336  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0006  tyrosyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
413 aa  336  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274156  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  45 
 
 
399 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
399 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
413 aa  336  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
399 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
399 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
405 aa  334  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
398 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
399 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
410 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
398 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
404 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  45 
 
 
399 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
388 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
396 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
399 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
414 aa  330  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
398 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
399 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
408 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
404 aa  329  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>