More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1546 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 410 aa  840    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 407 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 405 aa  408  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  51.26 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 398 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 454 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 407 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 406 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 421 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0300  tyrosyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139945  normal  0.0172609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 392 aa  360  3e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 395 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 398 aa  359  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 405 aa  358  7e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 392 aa  358  8e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>