More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2672 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
331 aa  664    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  89.39 
 
 
326 aa  595  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  73.78 
 
 
328 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
325 aa  331  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
317 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
317 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
317 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
316 aa  298  8e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
309 aa  278  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
309 aa  278  8e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
311 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
319 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
317 aa  266  5e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
345 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
361 aa  199  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
404 aa  192  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
348 aa  189  7e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  30.49 
 
 
824 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
336 aa  172  9e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
315 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
319 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  33.95 
 
 
349 aa  168  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
314 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
374 aa  159  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
372 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
372 aa  157  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  33.94 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  29.87 
 
 
791 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
400 aa  85.9  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  29 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 
406 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 
399 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
406 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  26.35 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.79 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  26 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
413 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
413 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 
404 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>