179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0733 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  88.17 
 
 
372 aa  679    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
372 aa  759    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  88.44 
 
 
372 aa  699    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  86.29 
 
 
372 aa  671    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 
374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
388 aa  348  9e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
348 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
361 aa  251  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
352 aa  233  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  36.27 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
317 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
317 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
313 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
315 aa  185  9e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
316 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
309 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
336 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
311 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
319 aa  173  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
319 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
326 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
317 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
328 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  34.94 
 
 
791 aa  139  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  31.13 
 
 
824 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
404 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  29.23 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.67 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  28.3 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
386 aa  59.7  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3111  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
326 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  hitchhiker  0.0000131467 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf703  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
331 aa  59.3  0.00000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.71 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.71 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.62 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.74 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06488  tryptophanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05340)  23.34 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000000462184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.14 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.14 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.14 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.9 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.43 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.56 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  30 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.31 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.2 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
357 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
357 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 
361 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 
345 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.53 
 
 
341 aa  53.1  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  29.19 
 
 
484 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 
401 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.03 
 
 
342 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.31 
 
 
337 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
374 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  25.57 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0213  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.354615  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1280  tyrosyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.703778  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl192  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.49 
 
 
350 aa  50.8  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00755732  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.35 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.31 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2136  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 
333 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 
400 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0166  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
333 aa  49.7  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.737336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.72 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46284  mitochondrial tryptophanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.9476  normal  0.247243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>