More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3111 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3111  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 326 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  hitchhiker  0.0000131467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2556  Tryptophan--tRNA ligase  56.07 
 
 		 321 aa  329  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0482  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 322 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317758  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 347 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 346 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0756  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00781625  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 334 aa  292  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 332 aa  292  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 346 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 346 aa  291  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4204  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 334 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  46.95 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0984  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 334 aa  282  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  47.59 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 332 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 332 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 345 aa  266  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0670  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167937 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0915  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.229161  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1294  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 338 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.52128 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>