More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0166 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0166  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
333 aa  681    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.737336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
328 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
329 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
328 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
329 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
329 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0575  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.415055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0995  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1014  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00140566  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf703  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
331 aa  298  8e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
344 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
327 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
332 aa  285  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
347 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
347 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0342  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
336 aa  281  1e-74  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.12931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
342 aa  279  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
346 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
327 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
347 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
341 aa  275  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0815  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
352 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl192  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
350 aa  272  6e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00755732  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
351 aa  272  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
339 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
332 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
346 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2136  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
331 aa  268  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
332 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0984  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
357 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4204  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
345 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
353 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
360 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
344 aa  262  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
333 aa  260  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
335 aa  259  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
340 aa  260  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  43.83 
 
 
334 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
344 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
344 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
344 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
336 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
328 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  41.1 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
331 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
334 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
337 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
334 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
334 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1294  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
338 aa  249  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.52128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
334 aa  248  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
332 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
338 aa  247  2e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
336 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
332 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
340 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
336 aa  245  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
332 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
332 aa  245  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0670  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
334 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
344 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
341 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
334 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  39.53 
 
 
342 aa  239  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
365 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>