More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1266 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
309 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  97.41 
 
 
309 aa  617  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  96.43 
 
 
311 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  85.06 
 
 
319 aa  548  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  75 
 
 
317 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
325 aa  343  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 
316 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
317 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
315 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
313 aa  329  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
331 aa  278  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
328 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
338 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
345 aa  256  4e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
361 aa  203  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
315 aa  202  5e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
319 aa  199  5e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
348 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
314 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
336 aa  193  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  35.23 
 
 
824 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
404 aa  182  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
372 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
374 aa  176  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
372 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
372 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.4 
 
 
349 aa  162  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
388 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  32.65 
 
 
397 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  28.91 
 
 
791 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
407 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
405 aa  92.8  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  33 
 
 
392 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
410 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
403 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
405 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
402 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
414 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  30 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 
403 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
395 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 
405 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 
405 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
432 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  30 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  28.69 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
398 aa  82.4  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
395 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  24.05 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
399 aa  79  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>