More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0194 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
317 aa  640    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  75.65 
 
 
309 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  76.3 
 
 
311 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  75.65 
 
 
309 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  72.99 
 
 
319 aa  463  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
317 aa  331  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
325 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
313 aa  328  7e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
313 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
315 aa  323  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
317 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
328 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
331 aa  277  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
326 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
345 aa  259  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
338 aa  251  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
345 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
315 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
336 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
352 aa  199  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
348 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
314 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  34.65 
 
 
824 aa  192  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
361 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
404 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
372 aa  176  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
372 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
372 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
374 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
388 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  31.8 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  30.28 
 
 
397 aa  142  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  29.56 
 
 
791 aa  108  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
406 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
407 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
395 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  26.42 
 
 
438 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
403 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 
399 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
392 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
405 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  30 
 
 
406 aa  89.4  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
410 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 
414 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
405 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
405 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
405 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
399 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
405 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
399 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  30 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 
413 aa  82.4  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
402 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3069  tyrosyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498889  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
454 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>