More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2463 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
313 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  77.24 
 
 
315 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  75.08 
 
 
313 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 
316 aa  498  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 
317 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
325 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 
317 aa  371  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
309 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
319 aa  332  5e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
311 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
309 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
328 aa  315  8e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
317 aa  315  8e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
338 aa  251  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
345 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
361 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
352 aa  205  9e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  36.42 
 
 
824 aa  202  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
372 aa  192  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
404 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
348 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
372 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
314 aa  183  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
319 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
336 aa  178  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
374 aa  175  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
372 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  34.28 
 
 
349 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
372 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  33.64 
 
 
397 aa  158  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
388 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  24.65 
 
 
791 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
395 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
401 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
408 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 
400 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
399 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3069  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
413 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498889  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
399 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
399 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
403 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
406 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
403 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
405 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
399 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
399 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
399 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
403 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
399 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
414 aa  89  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
413 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
403 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
432 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
402 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
403 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
403 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
404 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
399 aa  86.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
398 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 
413 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
399 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
399 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
398 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
407 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 
403 aa  85.9  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
400 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
406 aa  85.9  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
413 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>