More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0708 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
402 aa  809    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  64.76 
 
 
404 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
413 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
407 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
406 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
432 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
404 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
403 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
404 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
408 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
403 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
403 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
403 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
392 aa  378  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
413 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
412 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
401 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  47 
 
 
401 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
398 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
405 aa  364  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  46.1 
 
 
438 aa  364  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
403 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
410 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
416 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
413 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
454 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
416 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
397 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
413 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
398 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
413 aa  360  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
432 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
435 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
413 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
399 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
421 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
413 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
413 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
399 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
399 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
399 aa  354  1e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
405 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
421 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
407 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
402 aa  353  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
398 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
399 aa  354  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
400 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
399 aa  352  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
392 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  44 
 
 
404 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
399 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
405 aa  349  6e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3069  tyrosyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
413 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498889  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
396 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
402 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
401 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
398 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
399 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
399 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
395 aa  345  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
414 aa  345  8e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
399 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
399 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
406 aa  345  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
399 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
399 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1009  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
397 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
399 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
405 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
401 aa  342  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0841  tyrosyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
387 aa  341  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0450822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
398 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
403 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
399 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
405 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
399 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
399 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
401 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>