170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2062 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  88.98 
 
 		 372 aa  676    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  88.44 
 
 		 372 aa  699    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 372 aa  758    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  89.25 
 
 		 372 aa  680    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  36 
 
 		 349 aa  216  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 315 aa  190  4e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 313 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 316 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  33.46 
 
 		 791 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  30.98 
 
 		 824 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 404 aa  112  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  28.37 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  29.26 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.42 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.89 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.63 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.72 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.63 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.01 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.01 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf703  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3111  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  hitchhiker  0.0000131467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.26 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.01 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.01 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.01 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.76 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  30.27 
 
 		 484 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.21 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.72 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.43 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 333 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 		 358 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0166  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.737336  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.43 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.98 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.61 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  22.98 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06488  tryptophanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05340)  24.44 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000000462184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2136  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0213  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.354615  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.51 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.44 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46284  mitochondrial tryptophanyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.9476  normal  0.247243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 330 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0167  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  22.87 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 329 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 329 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>