More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0791 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
319 aa  645    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  93.63 
 
 
315 aa  604  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  84.57 
 
 
314 aa  560  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  81.21 
 
 
336 aa  534  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
352 aa  278  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
338 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
325 aa  206  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
317 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
309 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
311 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
319 aa  199  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
315 aa  199  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
317 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
317 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
313 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
372 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
328 aa  185  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
326 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
372 aa  176  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
388 aa  176  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
372 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
313 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.86 
 
 
349 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
374 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
348 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
345 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  30.36 
 
 
397 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  33.19 
 
 
791 aa  115  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  29.43 
 
 
824 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
410 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
413 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0845  tyrosyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0944  tyrosyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.567756  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 
403 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  24.14 
 
 
438 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4044  tyrosyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225408  normal  0.0290637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
405 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3541  tyrosyl-tRNA synthetase  24.87 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
407 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 
421 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>