More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2152 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
352 aa  718    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  68.64 
 
 
361 aa  526  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
338 aa  333  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
314 aa  285  7e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
336 aa  276  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
319 aa  271  1e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
388 aa  249  5e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
348 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
372 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
372 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
372 aa  229  6e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
374 aa  223  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
317 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.65 
 
 
349 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
317 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
317 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
345 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
315 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
316 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
319 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
313 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
328 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
309 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
309 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  35 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
317 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  31.15 
 
 
824 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  31.74 
 
 
791 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  28.65 
 
 
397 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
396 aa  89.4  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
413 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 
405 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
398 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
401 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  21.85 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  25.31 
 
 
395 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
414 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  24.85 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0300  tyrosyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139945  normal  0.0172609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  21.08 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>