More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2565 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
345 aa  690    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  73.91 
 
 
345 aa  525  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
317 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
325 aa  256  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
404 aa  250  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
316 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
319 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
317 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
315 aa  242  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
313 aa  242  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
309 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
311 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
317 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
328 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
326 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  41 
 
 
331 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  35.06 
 
 
824 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
317 aa  227  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  34.87 
 
 
397 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
361 aa  202  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
352 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
348 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
374 aa  178  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
338 aa  169  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
372 aa  166  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
372 aa  162  7e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
372 aa  156  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  33.14 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
388 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 
336 aa  123  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  26.48 
 
 
791 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
398 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 
398 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3699  tyrosyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0006  tyrosyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274156  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
398 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  28.63 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>