More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2505 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
328 aa  664    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  73.78 
 
 
331 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  71.34 
 
 
326 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
317 aa  328  9e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
325 aa  325  5e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
313 aa  315  8e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
315 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
317 aa  310  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
309 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
309 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
317 aa  269  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
345 aa  246  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
345 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
361 aa  221  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
352 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
338 aa  203  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
348 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
314 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
319 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
404 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
374 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
372 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  31.02 
 
 
824 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
372 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  31.69 
 
 
349 aa  162  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
372 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  32.33 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  28.41 
 
 
791 aa  112  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
400 aa  94  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
406 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  25.21 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
399 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.86 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  28.87 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  24.85 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>