More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0042 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
338 aa  682    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
352 aa  333  2e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
361 aa  317  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
309 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
311 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
309 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
348 aa  256  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
319 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
313 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
315 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
325 aa  246  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
336 aa  243  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
313 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
372 aa  240  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
316 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
372 aa  236  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  40.24 
 
 
349 aa  232  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
372 aa  225  7e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
388 aa  219  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
326 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
328 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
345 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  30.85 
 
 
791 aa  172  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  32.32 
 
 
824 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
404 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  26.97 
 
 
397 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  24.46 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0632  tyrosyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0611  tyrosyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
400 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
407 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 
390 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3069  tyrosyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498889  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 
401 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3699  tyrosyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 
403 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 
403 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0300  tyrosyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139945  normal  0.0172609 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  25.08 
 
 
438 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>