296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1431 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
386 aa  799    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  81.91 
 
 
381 aa  663    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
386 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
370 aa  436  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
379 aa  381  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
377 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
374 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
374 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
383 aa  353  4e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
424 aa  348  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  45.53 
 
 
484 aa  341  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  44.16 
 
 
405 aa  311  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  43.7 
 
 
424 aa  309  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
407 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
412 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  42.31 
 
 
641 aa  286  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
361 aa  219  7e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
358 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
357 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 
435 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 
537 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
432 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
432 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
534 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  26.53 
 
 
570 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  24.73 
 
 
422 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  25.65 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.78 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  28.38 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.56 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  27 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  28.3 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.25 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.43 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  24.47 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.41 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.41 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.02 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  26.16 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.97 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.78 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.25 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  20.51 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.81 
 
 
342 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  24.44 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
309 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 
345 aa  62.8  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.92 
 
 
328 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.49 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>