79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00430 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  100 
 
 
641 aa  1320    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
424 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  48.94 
 
 
424 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  46.88 
 
 
484 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  46.65 
 
 
405 aa  351  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
370 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
386 aa  296  6e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
381 aa  281  3e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
374 aa  259  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
379 aa  251  3e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
377 aa  249  8e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
374 aa  249  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
383 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
386 aa  248  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
412 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
407 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 
358 aa  148  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
361 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
358 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
357 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 
358 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.45 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 
327 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
342 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 
327 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 
537 aa  64.3  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.06 
 
 
542 aa  63.9  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
432 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  22.88 
 
 
570 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
338 aa  61.6  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 
473 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.57 
 
 
335 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 
534 aa  58.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  22.81 
 
 
422 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
418 aa  57  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  25.35 
 
 
418 aa  57  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 
331 aa  55.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.1 
 
 
346 aa  54.7  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.36 
 
 
345 aa  53.5  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.91 
 
 
339 aa  53.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 
317 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 
346 aa  51.6  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 
336 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 
351 aa  50.8  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
314 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
315 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
345 aa  50.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  24.1 
 
 
417 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
352 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  29.27 
 
 
340 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.22 
 
 
340 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 
404 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.51 
 
 
341 aa  48.5  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.26 
 
 
333 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 
418 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
319 aa  48.5  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 
311 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 
309 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 
325 aa  47.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 
327 aa  47.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.04 
 
 
341 aa  47  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.48 
 
 
366 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.43 
 
 
329 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 
388 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
327 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
340 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 
328 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  31.2 
 
 
349 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.47 
 
 
335 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 
340 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.09 
 
 
334 aa  44.3  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.47 
 
 
335 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
319 aa  44.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0484  tyrosyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
401 aa  44.3  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.55 
 
 
357 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>