134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0642 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  100 
 
 		 418 aa  866    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.94 
 
 		 418 aa  630  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  69.23 
 
 		 417 aa  627  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  67.33 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 418 aa  553  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 357 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  33.4 
 
 		 570 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 537 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 542 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 540 aa  249  9e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  23.49 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  24.82 
 
 		 484 aa  97.4  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 381 aa  96.7  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.21 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  23.37 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.43 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  23.08 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.8 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 		 324 aa  57  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  25.35 
 
 		 641 aa  57  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  24.86 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.19 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.35 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 330 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 325 aa  53.9  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 323 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.9 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.37 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.44 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2556  Tryptophan--tRNA ligase  27.27 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 328 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 328 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>