More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0343 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
392 aa  805    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
391 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
329 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
326 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
327 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
324 aa  319  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
327 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
404 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 
337 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
327 aa  292  6e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
404 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
404 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
405 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
329 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
405 aa  279  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
331 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
405 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
330 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
331 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
400 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
400 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
403 aa  275  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
403 aa  275  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
400 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
402 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
391 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
400 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
329 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
325 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
329 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
327 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  34.69 
 
 
331 aa  249  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
400 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
327 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
330 aa  239  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
326 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
404 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
329 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
359 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
332 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
328 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
330 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
354 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
330 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
328 aa  224  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
328 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
333 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
329 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  33.08 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
340 aa  213  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
329 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
342 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
340 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
348 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
340 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
323 aa  206  8e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
325 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
443 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
340 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
323 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
323 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.54 
 
 
337 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.28 
 
 
337 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.54 
 
 
342 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.28 
 
 
337 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.28 
 
 
337 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
384 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.28 
 
 
337 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
335 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
331 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.28 
 
 
342 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
330 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 
335 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
400 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.99 
 
 
340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 
353 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
365 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
449 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>