More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1466 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 403 aa  828    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 403 aa  828    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 		 405 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.45 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 405 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.74 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 400 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 404 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 404 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 392 aa  285  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 329 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 327 aa  259  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 327 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 327 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 330 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 340 aa  236  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 340 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.65 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 		 324 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 323 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 329 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 342 aa  222  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 323 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 329 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 326 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 328 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 328 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2580  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 332 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.804405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 333 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 333 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 335 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 327 aa  176  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 330 aa  176  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>