192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1932 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  88.17 
 
 
372 aa  703    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
372 aa  755    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  88.98 
 
 
372 aa  701    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  86.56 
 
 
372 aa  665    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 
374 aa  455  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
388 aa  342  5e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
361 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
352 aa  242  9e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
338 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  34.67 
 
 
349 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
317 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
325 aa  199  7e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
315 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
313 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
315 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
317 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
316 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
336 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
319 aa  176  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
319 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
311 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
309 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
326 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
317 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  34.2 
 
 
791 aa  142  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  31.25 
 
 
824 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  27.79 
 
 
397 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3111  tryptophanyl-tRNA synthetase  28 
 
 
326 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  hitchhiker  0.0000131467 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.22 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf703  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.29 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.64 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
352 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  25.6 
 
 
484 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.68 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0213  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
330 aa  57.4  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.354615  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.56 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.21 
 
 
342 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl192  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00755732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2136  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.6 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06488  tryptophanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05340)  24.05 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000000462184 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 
329 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 
329 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 
329 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 
357 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 
332 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
396 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
329 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0166  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.737336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
329 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
329 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
329 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  28.06 
 
 
424 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
329 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
357 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  26.72 
 
 
360 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
357 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.14 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 
338 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 
339 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0167  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
333 aa  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 
400 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>