173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45368 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  100 
 
 		 791 aa  1635    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  53.39 
 
 		 349 aa  379  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 361 aa  177  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 338 aa  172  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 352 aa  154  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 374 aa  147  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 372 aa  142  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 372 aa  141  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 372 aa  139  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 372 aa  139  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 315 aa  124  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 317 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 316 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 325 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 319 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 336 aa  114  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 314 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 328 aa  112  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 326 aa  108  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 331 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 309 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  25.72 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 313 aa  103  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 309 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  24.65 
 
 		 313 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 317 aa  99.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 317 aa  98.2  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 319 aa  96.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 345 aa  90.9  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 317 aa  90.9  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  27.25 
 
 		 824 aa  83.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  23.02 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 386 aa  62  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 335 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.35 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06488  tryptophanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05340)  22.62 
 
 		 384 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000000462184 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 345 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 416 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 454 aa  55.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 435 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.53 
 
 		 342 aa  55.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 335 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 346 aa  55.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 413 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 413 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 413 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 413 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 413 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 413 aa  54.7  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 413 aa  54.7  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0728  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 414 aa  54.3  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 432 aa  54.3  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0506  tyrosyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 410 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 386 aa  53.5  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 413 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 		 344 aa  53.5  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 413 aa  53.5  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4106  tyrosyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 352 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 413 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 413 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 413 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 413 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 416 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 361 aa  52.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 377 aa  51.6  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 413 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 339 aa  51.6  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.96 
 
 		 346 aa  51.6  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3699  tyrosyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 393 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 351 aa  51.2  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2556  Tryptophan--tRNA ligase  23.04 
 
 		 321 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.67 
 
 		 341 aa  51.2  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.34 
 
 		 344 aa  50.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 399 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 398 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.52 
 
 		 341 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 400 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46284  mitochondrial tryptophanyl-tRNA synthetase  23.02 
 
 		 379 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.9476  normal  0.247243 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  23.79 
 
 		 424 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 401 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 401 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 390 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 		 384 aa  49.7  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 349 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 328 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 399 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 328 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 397 aa  49.3  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 		 399 aa  49.3  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>