More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46284 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46284  mitochondrial tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 379 aa  793    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.9476  normal  0.247243 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06488  tryptophanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05340)  45.29 
 
 		 384 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000000462184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 354 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 345 aa  262  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 332 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 332 aa  259  8e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 332 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 357 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 355 aa  252  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 356 aa  252  9.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 350 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 336 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 347 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 347 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 346 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 329 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 329 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 329 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 341 aa  239  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 332 aa  239  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 337 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 340 aa  238  9e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 334 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>