More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1020 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
333 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.73 
 
 
331 aa  494  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 
347 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 
332 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 
357 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 
357 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 
341 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
335 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 
353 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 
353 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 
353 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 
345 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 
354 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 
341 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
348 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 
349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 
347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.94 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 
342 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 
345 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 
347 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.06 
 
 
347 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.94 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 
355 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 
355 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 
355 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
354 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
354 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
356 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
354 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
354 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 
331 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 
339 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
332 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
332 aa  305  6e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
346 aa  302  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
337 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
337 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
336 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
337 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
336 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
330 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
337 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
335 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
355 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
351 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
347 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
337 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
338 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
337 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
338 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
327 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
328 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
338 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
331 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
337 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  48.34 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0167  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
333 aa  281  9e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
338 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
338 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
340 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
335 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
333 aa  277  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
341 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
332 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
344 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
365 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
353 aa  272  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
345 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
337 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
348 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  44.8 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
329 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
328 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
332 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
332 aa  268  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
332 aa  268  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
334 aa  268  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>