More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0894 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
341 aa  704    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.51 
 
 
341 aa  554  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.27 
 
 
342 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 
347 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 
357 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.13 
 
 
357 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.34 
 
 
339 aa  464  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 
335 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
332 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
353 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 
347 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 
348 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 
350 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 
354 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 
350 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 
349 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 
347 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.8 
 
 
354 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 
354 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.89 
 
 
355 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
355 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
355 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
344 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 
347 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
355 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
350 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.29 
 
 
345 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.43 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 
344 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 
345 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 
356 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
339 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 
333 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 
344 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 
331 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
331 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 
332 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
332 aa  330  2e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
332 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
332 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
332 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
332 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
337 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
332 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
332 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
332 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
332 aa  292  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
334 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
351 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
333 aa  291  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
334 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
328 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
332 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
346 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
346 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
334 aa  285  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
355 aa  285  9e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
328 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
334 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
334 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  44.58 
 
 
334 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
334 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
334 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
330 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
335 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
337 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
336 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
332 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
334 aa  278  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
332 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
345 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
332 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  42.9 
 
 
342 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
334 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
332 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
335 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
328 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>