More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1211 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1211  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 402 aa  825    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0499  tyrosyl-tRNA synthetase  73.38 
 
 		 402 aa  608  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.349459  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1407  tyrosyl-tRNA synthetase  69.5 
 
 		 401 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0454  tyrosyl-tRNA synthetase  69.5 
 
 		 401 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000282081  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1287  tyrosyl-tRNA synthetase  69.25 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000394175  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0484  tyrosyl-tRNA synthetase  70.32 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0618  tyrosyl-tRNA synthetase  68.42 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1280  tyrosyl-tRNA synthetase  64.75 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.703778  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0648  tyrosyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 399 aa  536  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 398 aa  428  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 398 aa  421  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 399 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 403 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0300  tyrosyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139945  normal  0.0172609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 421 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 413 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0632  tyrosyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02940  tyrosyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>