More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0499 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0484  tyrosyl-tRNA synthetase  81.41 
 
 
401 aa  676    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0499  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
402 aa  832    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.349459  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1287  tyrosyl-tRNA synthetase  73.93 
 
 
401 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000394175  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0618  tyrosyl-tRNA synthetase  74.37 
 
 
400 aa  623  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1407  tyrosyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 
401 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0454  tyrosyl-tRNA synthetase  73.18 
 
 
401 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000282081  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1211  tyrosyl-tRNA synthetase  73.38 
 
 
402 aa  615  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0648  tyrosyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 
402 aa  595  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  69.52 
 
 
399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1280  tyrosyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 
403 aa  580  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.703778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
398 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
403 aa  441  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
403 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
401 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
398 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
395 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
403 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
399 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
399 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
404 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
403 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  59.24 
 
 
403 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
398 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  54 
 
 
401 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
401 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
408 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
395 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
404 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
408 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
395 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
398 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
402 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 
398 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
397 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
396 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
398 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 
399 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  55 
 
 
398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
397 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
413 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
410 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
399 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4106  tyrosyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
410 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
410 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
400 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
392 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
413 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
421 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
435 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
413 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
454 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
406 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0611  tyrosyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
410 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
413 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
413 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
421 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
400 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
413 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
407 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
413 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
407 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
413 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
413 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
395 aa  395  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
399 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0506  tyrosyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
410 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0632  tyrosyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
410 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
399 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
399 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
410 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
399 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
413 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
399 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
410 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>