More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0648 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0648  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
402 aa  830    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0499  tyrosyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 
402 aa  591  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.349459  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  69.1 
 
 
399 aa  585  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0618  tyrosyl-tRNA synthetase  69.42 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0454  tyrosyl-tRNA synthetase  67.75 
 
 
401 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000282081  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1287  tyrosyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 
401 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000394175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1407  tyrosyl-tRNA synthetase  68 
 
 
401 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0484  tyrosyl-tRNA synthetase  68.96 
 
 
401 aa  567  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1211  tyrosyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 
402 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1280  tyrosyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 
403 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.703778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
398 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 
403 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 
403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
403 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 
395 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 
408 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 
403 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
398 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
403 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
400 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
395 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
399 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
397 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
413 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
413 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
435 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
398 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
413 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
413 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
399 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 
398 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
395 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
413 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
413 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
398 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
413 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
399 aa  421  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
397 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
454 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
398 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
413 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
398 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
406 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
401 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
413 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
432 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0911  tyrosyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
407 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000280403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
416 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
413 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
413 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
399 aa  418  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
397 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
413 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  54 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
403 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  55 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
399 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
395 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  55 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
400 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
398 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
416 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
396 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
399 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
407 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
399 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1094  tyrosyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
416 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.63976  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
399 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
399 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
399 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
413 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
410 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
399 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>