More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05470 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05470  alanine-glyoxylate transaminase, putative  100 
 
 
382 aa  766    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01342  hypothetical alanine--glyoxylate aminotransferase (Eurofung)  53.17 
 
 
386 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000773374  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  48.01 
 
 
379 aa  355  5.999999999999999e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  34.19 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  33.71 
 
 
383 aa  190  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  34.08 
 
 
390 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  33.07 
 
 
380 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.71 
 
 
377 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  32.27 
 
 
378 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  32.68 
 
 
367 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  32.45 
 
 
377 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  32.18 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  33.24 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  32.18 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  32.18 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  32.45 
 
 
377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  32.71 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  31.87 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.18 
 
 
377 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.91 
 
 
377 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  31.87 
 
 
380 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  30.13 
 
 
381 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  30.77 
 
 
380 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.08 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0406  aminotransferase class V  32.66 
 
 
384 aa  166  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.472989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  32.31 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  32.68 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  32.4 
 
 
382 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.6 
 
 
384 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  31.75 
 
 
373 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.1 
 
 
366 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  31.2 
 
 
370 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  30.95 
 
 
376 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  30.86 
 
 
381 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  28.88 
 
 
381 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  29.82 
 
 
388 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.53 
 
 
394 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  29.26 
 
 
396 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  30.7 
 
 
375 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.98 
 
 
380 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  30.53 
 
 
404 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  29.18 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  29.62 
 
 
375 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  30.53 
 
 
401 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  31.56 
 
 
372 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  30.3 
 
 
393 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.56 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  30.87 
 
 
369 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  28.45 
 
 
384 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  29.71 
 
 
386 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  30.34 
 
 
375 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.08 
 
 
363 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  30.94 
 
 
388 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.28 
 
 
394 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  27.64 
 
 
382 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.69 
 
 
394 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.49 
 
 
394 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  27.88 
 
 
379 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  27.17 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  27.17 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  27.35 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  30.75 
 
 
362 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  27.25 
 
 
394 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  27.53 
 
 
413 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  30.31 
 
 
385 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  30.46 
 
 
362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.33 
 
 
394 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  31.55 
 
 
384 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  28.8 
 
 
384 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  26.56 
 
 
391 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.79 
 
 
382 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  28.8 
 
 
384 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.79 
 
 
382 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  28.49 
 
 
360 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  27.73 
 
 
380 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  28.12 
 
 
380 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  27.25 
 
 
377 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.58 
 
 
395 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.27 
 
 
380 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.6 
 
 
362 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  29.07 
 
 
357 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  26.76 
 
 
384 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  31.58 
 
 
396 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  31.58 
 
 
396 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  30.61 
 
 
371 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  28.57 
 
 
380 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.97 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  27.76 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  27.5 
 
 
380 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  27.54 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  30.97 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  26.79 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  28.1 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  29.4 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  27.59 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  30.66 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.42 
 
 
386 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  30.79 
 
 
384 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  25.84 
 
 
382 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>