More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44075 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  100 
 
 		 379 aa  763    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05470  alanine-glyoxylate transaminase, putative  48.01 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01342  hypothetical alanine--glyoxylate aminotransferase (Eurofung)  46.32 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000773374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  34.12 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  37.96 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  35.34 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  35.24 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  33.24 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.58 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  32.87 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0406  aminotransferase class V  35.24 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.472989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  30.84 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.59 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  31.12 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  32.08 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  33.72 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  32.1 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  33.05 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  30.95 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  31.28 
 
 		 380 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30.62 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 384 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  33.14 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  30.34 
 
 		 417 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  31.18 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  31.53 
 
 		 406 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  31.07 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  30.51 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  32.29 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.32 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  33.14 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  31.81 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  30.97 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  31.05 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.99 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  32.19 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.98 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  31.03 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  30.57 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  31.73 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  29.95 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  31.2 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  28.95 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  31.71 
 
 		 386 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  31.32 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  29.89 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.6 
 
 		 377 aa  159  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  30.2 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  30.86 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  31.39 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  28.7 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  29.73 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.23 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  29.14 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  28.86 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  29.73 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  28.49 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  31.58 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  28.72 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  30.77 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  30.77 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  31.55 
 
 		 378 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  32.26 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  31.41 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  31.7 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  29.97 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.02 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  29.52 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.27 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  29.27 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  28.3 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.73 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  31.33 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  28.69 
 
 		 406 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  28.07 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  29.01 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  30.84 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.95 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  26.97 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  30.15 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  29.18 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.75 
 
 		 377 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  30.52 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  30.29 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  29.95 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  29.89 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  28.73 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  27.3 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  28.57 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  30.23 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  30.32 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  27.95 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.65 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  27.42 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>