More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5630 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  100 
 
 		 401 aa  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  74.07 
 
 		 406 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  72.59 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  71.36 
 
 		 406 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  69.88 
 
 		 406 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  69.63 
 
 		 406 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  69.63 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  68.96 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  72.14 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  69.5 
 
 		 403 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  67.09 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  70.98 
 
 		 391 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  66.83 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  70.98 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  69.82 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  65.74 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  71.92 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  69.11 
 
 		 402 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  68.35 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  67.46 
 
 		 401 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  65.97 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  67.85 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  63.96 
 
 		 398 aa  521  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  63.54 
 
 		 394 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  60.97 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  62.3 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  68.28 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  66.32 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  52.28 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  50.39 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  49.75 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  50.13 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  50.52 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  51.21 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  51.03 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  49.23 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  49.23 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  49.23 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  46.98 
 
 		 391 aa  362  9e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  50.66 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  47.48 
 
 		 396 aa  359  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 391 aa  358  7e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  45.88 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  47.18 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  45.62 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  46.75 
 
 		 396 aa  342  9e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  46.67 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  47.92 
 
 		 396 aa  332  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  41.03 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  44.61 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  40 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  41.3 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  42.08 
 
 		 395 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.74 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.74 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  38.83 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  40.96 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  41.16 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.89 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  38.7 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  41.47 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  40.57 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  38.7 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  41.55 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  41.32 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  41.6 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  39.25 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.61 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.38 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  39.35 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  39.05 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  38.83 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  37.71 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  42.09 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  37.89 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.36 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  38.92 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  36.03 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  41.81 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  36.44 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  38.23 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  36.62 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.61 
 
 		 384 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  36.32 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.77 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  39.9 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  39.9 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  35.9 
 
 		 386 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  38.22 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  36.41 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  35.9 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.92 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  35.96 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.26 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  35.53 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  35.2 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  34.95 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  34.31 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>